Per creare un collegamento ipertestuale attraverso javascript puoi fare così:

codice:
// Recuperiamo innanzitutto l'elemento 'body'
var pagina = document.getElementsByTagName('body').item(0)

// Creiamo un nuovo link...
var a = document.createElement('a')
// ... e il testo che andrà in esso
var a_testo = document.createTextNode('home page')
// Quindi inseriamo il testo nel link
a.appendChild(a_testo)

// Infine inseriamo il link nella pagina
pagina.appendChild(a)
Mi puzza lo scopo, comunque. Cos'è che devi fare, esattamente?