La butto lì...
Se ho capito bene stai parlando di SugarCRM, quindi un portale web in PHP.
Proverei a fare un file .bat che apre internet explorer con l'indirizzo voluto

es: iexplore.exe "http://sito_sugar/cron.php"

(ho fatto una prova con iexplore.exe "www.html.it" e funziona, cioè lo apre correttamente, non so se vada bene anche con altre sintassi, come quella http://aaaaaa)

Vedo anche un altro problema; le operazioni pianificate hanno intervallo minimo, se non sbaglio, di un giorno...cioè puoi decidere un'ora prestabilita in cui far eseguire le cose ogni giorno; non puoi mettere intervalli minori
Potresti fare 288 operazioni pianificate ognuna per ogni intervallo di 5 minuti di una giornata... ma non mi sembra una grande idea....

P.S
Hai guardato i PVT ?