E' sbagliata l'impostazione...richiami la funzione vedinonvedi() in ogni caso, quindi il div corrispondente viene mostrato.
Ti ho modificato il codice per renderlo più semplice e per evitare che ti mostri il messaggio di errore nel caso l'utente provi a selezionare entrambi i checkbox. Ora è possibile selezionarli solo uno per volta, oppure non selezionarne nessuno. Inoltre, quando imposti delle proprietà di stile, come display, devi farlo accedendo all'oggetto style.

codice:
<script type="text/javascript">
function ctr(id) {
if (document.getElementById(id).checked==true) {
if (document.getElementById(id).value=="artistico") {
document.getElementById("cla").checked = false;
document.getElementById("div_" + id).style.display = "";
document.getElementById("div_cla").style.display = "none";
}
else {
document.getElementById("art").checked = false;
document.getElementById("div_" + id).style.display = "";
document.getElementById("div_art").style.display = "none";
}
}
else {
document.getElementById("div_" + id).style.display = "none";
}
}
</script>
</head>
<body>

<input type="checkbox" id="art" name="spec_art" value="artistico" onclick="ctr(this.id);"> 

Artistico
<input type="checkbox" id="cla" name="spec_cla" value="classico" onclick="ctr(this.id);"> 

Classico

<div id="div_art" style="display: none;">

<input type="text" name="capacità_art" value="20" disabled="disabled" size="5"> 
<input type="text" name="capacità_let" value="5" disabled="disabled" size="5"> 
<input type="text" name="capacità_lin" value="0" disabled="disabled" size="5"> 
<input type="text" name="capacità_psi" value="10" disabled="disabled" size="5"> 
<input type="text" name="capacità_mat" value="5" disabled="disabled" size="5"> 

</div>

<div id="div_cla" style="display: none;">

<input type="text" name="capacità_art" value="0" disabled="disabled" size="5"> 
<input type="text" name="capacità_let" value="20" disabled="disabled" size="5"> 
<input type="text" name="capacità_lin" value="10" disabled="disabled" size="5"> 
<input type="text" name="capacità_psi" value="5" disabled="disabled" size="5"> 
<input type="text" name="capacità_mat" value="5" disabled="disabled" size="5">
</div>
Se hai dei dubbi chiedi pure!

PS: evita le lettere accentate nei valori degli attributi id e name.