grazie per il link, ma il codice nn era neanche completo e avrei poi dovuto fare una conversione dal basic.
Ho risolto utilizzando il progetto JACOB reperibile qui http://sourceforge.net/projects/jacob-project/ e http://danadler.com/jacob/

é un progetto interessante perchè permette di utilizzare tutti i programmi principali del pacchetto office e svolgere varie operazioni con il loro contenuto.
Nel codice che ho postato sostituendo il valore della variabile che ho evidenziato vi è la possibilita di salvare le slide in altri formati

#DEFINE ppSaveAsHTML 12
#DEFINE ppSaveAsHTMLv3 13
#DEFINE ppSaveAsHTMLDual 14
#DEFINE ppSaveAsMetaFile 15
#DEFINE ppSaveAsGIF 16
#DEFINE ppSaveAsJPG 17
#DEFINE ppSaveAsPNG 18
#DEFINE ppSaveAsBMP 19
#DEFINE ppSaveAsWebArchive 20
#DEFINE ppSaveAsTIF 21
#DEFINE ppSaveAsPresForReview 22
#DEFINE ppSaveAsEMF 23


codice:
import com.jacob.activeX.*;
import com.jacob.com.*;

public class Ppt {
	ActiveXComponent pptapp = null;  //PowerPoint.Application ActiveXControl Object
	  Object ppto = null;  //PowerPoint.Application COM Automation Object
	  Object ppts = null;  //Presentations Set
	  // Office.MsoTriState
	  public static final int msoTrue = -1;
	  public static final int msoFalse = 0;
	  // PpSaveAsFileType
	  public static final int ppSaveAsJPG = 17 ;
	  //ppSaveAsJPG 17 

	  public Ppt(){
	    try{
	    	 pptapp = new ActiveXComponent("PowerPoint.Application");
	      ppto = pptapp.getObject();
	      
	      ppts = Dispatch.get((Dispatch)ppto, "Presentations").toDispatch();
	      
	    }catch(Exception e){
	      e.printStackTrace();
	    }
	  }
	  public Dispatch getPresentation(String fileName){
	    Dispatch pres = null; //Presentation Object
	    try{
	      pres = Dispatch.call((Dispatch)ppts, "Open", fileName,
	        new Variant(Ppt.msoTrue), new Variant(Ppt.msoTrue),
	        new Variant(Ppt.msoFalse)).toDispatch();
	    }catch(Exception e){
	      e.printStackTrace();
	    }
	    return pres;
	  }
	  public void saveAs(Dispatch presentation, String saveTo, int ppSaveAsFileType){
	    try{
	      Object slides = Dispatch.get(presentation, "Slides").toDispatch();
	      Dispatch.call(presentation, "SaveAs", saveTo, new Variant(ppSaveAsFileType));
	    }catch (Exception e) {
	      e.printStackTrace();
	    }
	   
	  }
	  public void closePresentation(Dispatch presentation){
	      if(presentation != null){
	      Dispatch.call(presentation, "Close");
	    }
	  }
	  public void quit(){
	      if(pptapp != null){
	      ComThread.Release();
	      
	      //pptapp.release();
	      pptapp.invoke("Quit", new Variant[]{});
	    }
	  }
	  public static void main(String[] args){
	  	Ppt a = new Ppt();
	  	System.out.println("inizio");
	    Dispatch pres = a.getPresentation("C:\\Documents and Settings\\Andrea\\Desktop\\progetti\\PptToJpeg\\PerEl05.ppt");//inserire percorso file ppt
	    
	    
	    a.saveAs(pres, "C:\\Documents and Settings\\Andrea\\Desktop\\progetti\\PptToJpeg\\SlidesJpg", Ppt.ppSaveAsJPG); //inserire percorso destinazione file
	    
	    a.closePresentation(pres);
	    a.quit();
	    System.out.println("fine");
	  }

}
magari può essere aggiunta nelle discussioni utili