Per amd64 la mia gentoo funziona benissimo e non mi da problemi di sorta. Inoltre per rispondere alla tua domanda Enrico, i pochi pacchetti che puoi installare anche come binari in caso di necessità (non esiste il pacchetto amd64) possono girare tranquilli a 32 bit.
Concordo con francofait circa i problemi per il flash, ma per quanto ne so io (anche se non l'ho provato) basta installare sia browser che plugin nella versione a 32 bit per far funzionare tutto.