usa le faux columns (false colonne)

http://alistapart.com/articles/fauxcolumns/
http://css.html.it/articoli/leggi/46...nne-con-i-css/

se sai che una delle due colonne sarà sempre più alta non ti serve in realtà aumentare l'altezza della più bassa... in realtà è sufficiente che lo sfondo del blocco che contiene entrambe le colonne sia fatto in modo da ripetersi in modo da simularle... ovvero un sfondo da ripetere verticalmente che dia l'illusione della presenza delle colonne.