Se ho capito bene:

Codice PHP:

//array di prova
$clienti["societa1"][2]= 80;
$clienti["societa1"][4]= 120;
$clienti["societa1"][10]= 250;
$clienti["societa2"][1]= 300;
$clienti["societa2"][2]= 200;
$clienti["societa3"][1]= 150;

foreach(
$clienti as $k => $v){
    for(
$i=1$i<=12$i++){
        if(!isset(
$v[$i])){
            
$clienti[$k][$i]=0;
        }
    }
    
ksort($clienti[$k]);//non so se ti è utile
}
echo
'<pre>';
print_r($clienti);
echo
'</pre>'