Copiare tutto via windows potrebbe non essere abbastanza, ma se fino ad ora hai usato ghost con buoni risultati non vedo perchè tu non possa sfruttarlo per clonare una partizione su un'altra. Invece che fare un'immagine, fai direttamente da una partizione di un disco, ad una dell'altro. Alla fine, testi la nuova partizione, vedi se funziona e poi formatti il disco "vecchio".