Il compilatore di VB6 è incluso nell'eseguibile VB6.exe, che tra l'altro è anche l'eseguibile dell'IDE. Per sapere come richiamarlo per compilare un progetto consulta la documentazione MSDN. In ogni caso tieni conto che il programma in questione per funzionare come dici tu necessita che sul sistema ci sia il codice sorgente e l'intero ambiente di sviluppo di VB6, condizione piuttosto improbabile.