firefox, synaptic ed i programmi che usano le librerie gtk non hanno i font controllabili dal centro di controllo di kde, dato che quest'ultimo utilizza le librerie qt.

potresti provare ad installare il pacchetto:

gtk2-engines-gtk-qt

come dice la descrizione:

theme engine using Qt for GTK+ 2.x

in questo modo anche le applicazioni gtk2 useranno i widgets e i font simil qt.

Io in passato ho avuto problemi specie con firefox, quindi provalo e se qualcosa non ti funziona vai di apt-get remove --purge gtk2-engines-gtk-qt