In primo luogo il più recente SP per Windows 2000 è l'SP4, per cui ti consiglio in primo luogo di installarlo, assieme a tutti gli altri aggiornamenti disponibili su Windows Update.
Riguardo al messaggio di errore, è molto chiaro: inserisci nella chiave di registro "HKLM\software\microsoft\.netframework\installroot " il percorso radice delle installazioni del .NET Framework.
Apri blocco note, incolla il seguente testo:
codice:
Windows Registry Editor Version 5.00

[HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\.NETFramework\]
"InstallRoot"="C:\\WINNT\\Microsoft.NET\\Framework\\"
e salvalo come "test.reg" (o quello che preferisci, l'importante è che abbia come estensione ".reg"), selezionando nella casella "Salva come" della finestra di salvataggio "Tutti i file". Quindi fai doppio click sul file in questione, rispondendo positivamente alla richiesta di conferma.