Ciao,

puoi scaricare la versione binaries. Ti troverai uno .zip. Lo decomprimi e copi il contenuto della cartella Emule047b nella cartella dove hai installato Emule (di solito c:\programmi\emule\). Ti kiederà di sovrascrivere e gli dai OK.
In questo modo aggiorni solo i file del programma. Non ricordo, ma penso ti si presenterà cmq il wizard di avvio, tuttavia, cosa importante, tutti i temporanei saranno salvi