Non è possibile. PHP è un linguaggio lato server e come tale interpreta la pagina prima di spedirla al client. JavaScript invece agisce lato client manipolando il DOM e interagendo con l'utente. Qualunque cosa tu voglia fare con PHP ti obbliga quindi sempre a ricaricare la pagina o ad aprirne un'altra in cui sia presente lo script PHP che deve girare. Al massimo puoi perciò usare JavaScript per reindirizzare ad una nuova pagina PHP contenente lo script che ti interessa.