Se fai una ricerca tra i vecchi post spunteranno una marea di discussioni circa le migliori distro a 64bit, sui vantaggi e svantaggi di ambienti a 64 bit puri e non, eccetera.
Io sulla gentoo per amd64 mi ci trovo benissimo. Per pacchetti grossi - vedi thunderbird, firefox, openoffice - ci sono oltre ad i sorgenti anche i binari a 32 bit, in questo modo puoi ad esempio evitare i problemi con flash che non gira su browser a 64 bit.
Tieni presente però che non ho mai provato altre distro a 64 Di certo per mettere e mantenere gentoo serve un po' più tempo rispetto alle altre, ma la documentazione disponibile è immane ec'è una guida praticamente per ogni cosa.
Sarebbe un peccato prendere un processore a 64 e poi usarlo come se fosse uno comune a 64. Che sia gentoo od un altra il mio consiglio è di sfruttarlo.