<script type="text/javascript">
var so = new SWFObject("movie.swf", "mymovie", "200", "100", "7", "#336699");
so.addVariable("variable1", "value1");
so.addVariable("variable2", "value2");
so.addVariable("variable3", "value3");

so.write("flashcontent");
</script>
Puoi passare una variabile in questo modo.
E nel flash la valuti subito con un if.

Se no, metodo più veloce, crei 2 swf uno per la home (animazione completa) e uno per le altre pagine.