Da quello che vedo dovrebbe essere php, vedi tu come concatenare il numero della matricola da passare alla pagina MenuUtente.php:
codice:
<frameset rows='10%,*'>
<frame name=Utente id=Utente src=Utente.php>
<frameset cols='19%,*''>
<frame name='MenuUtente' src='MenuUtente.php?matricola=ValoreDellaVariabileMatricola'>
<frameset rows='100%,*'>
<frame src='InizioUtente.php' name='InizUtente'>
</frameset>
</frameset>
</frameset> 
</html>";
Nella pagina MenuUtente.php recuperi il valore passato via querystring:
codice:
<script type="text/javascript">
  var matricola = "";
  
  if (location.search) {
    // Visto che si ha un solo parametro viene letto tutto ciò
    // che è a destra del carattere "=" della querystring
    // Es: "?matricola=valoreMatricola
    matricola = location.search.split("=")[1]
  }

  //a questo punto hai la variabile, ci fai quello che vuoi
  document.write("<span>" + matricola + </span>);
</script>