Ho trovato la soluzione al problema.
Come promesso, la posto qui, nel caso qualcuno ne avesse di bisogno.
Nella pagina html che esegue l'istruzione top.location.reload() e che riceve il messaggio "Permission Denied" a causa del differente dominio fra l'applicazione ospitante e l'applicazione ospitata, è necessario inserire la seguente istruzione nell'head della pagina stessa:

<script type="text/javascript">
document.domain = "dominioApplicazioneOspitante";
</script>


Thanks for all
Miche