Beh, entrambi sono recenti e ampiamente supportati (sicuramente più di fortran).
Per python hai l'ottimo scipy:
http://www.scipy.org/
Considerando che sei all'inizio e che l'informatica non è propriamente il tuo mestiere, potrebbe essere più sensato optare per Python dato che il tempo di apprendimento rispetto a Java è di molto inferiore.
A te la scelta.