E' difficile da spiegare senza farti vedere, ma aimè non posso, trattasi di intranet...non saprei come essere più chiaro però...
Comunque, è difficile per te assimilarlo perchè è abbastanza assurdo...non ho mai visto una cosa del genere... l'applicazione agisce anche sulle scrollbars di destra e sotto, come se non esistessero, come non ci fossero. mmmh... Non so come essere più chiaro...

immagina, come se il div contenitore abbia uno Z-index superiore a tutti, barre di scorrimento del browser (questo come fai a non capirlo?) compreso.