E' meglio usarli pacchettizzati. Sono in continua evoluzione e purtroppo a volte devono essere aggiornati per bug o problemi di sicurezza, quindi per snellire le operazioni di aggiornamento è meglio utilizzare i pacchetti (sai che palla ricompilare tutto ogni volta...).
Se posso dire la mia sulla distro ti consiglio Debian (Sarge)