Codice PHP:
$fp = fopen('lista_file.txt', 'w');
fwrite($fp, implode("\r\n", glob('*.*')));
fclose($fp); 
per la ricerca dei file
http://it.php.net/manual/it/function.glob.php

per la scrittura su file
http://it.php.net/manual/it/function.fopen.php