è un pò confusionario...
sei vuoi effettuare un controllo sul file che carichi, prima effettui il controllo con is_uploaded_file
se questo controllo va a buon fine, allora copy il contenuto sulle altre cartelle,
ricorda però che la variabile $newfile deve contenere il percorso del file con il suo nome:
esempio $newfile='/cartella/nomefile.txt'
se vuoi che il nuovo file abbia lo stesso nome fai cos':
$newfile='/cartella/'.$_FILES['nome_file']['name'];