il log di mysql fra l'altro è pieno di errori
è un po vago. che tipo di errori? per esempio potresti provare ad aumentare i valori di max_user_connections e max_connections nel file my.cfg. Fai una ricerca per "tuning mysql" e vedi un po se trovi informazioni. 60 utenti contemporanei sono un bel po' e probabilmente la configurazione hardware potrebbe non essere sufficiente per gestirli. Zend Optimizer e' decisamente fondamentale nel tuo caso, non mi hai detto se e' installato.