la classe PhotoMatrixMotion prevede un metodo onMotionFinished che consente di effettuare delle azioni nel momento in cui un'animazione si conclude, direi perciò che si potrebbe sfruttare per avviare un setTimeout (nel caso di Flash8) o setInterval per avviare la seconda funzione
es.
Codice PHP:
var effect = new PhotoMatrixMotion(target_mc, "luminance", "normal", None.easeNone, 30, false);
effect.onMotionFinished = function() {
setTimeout(function () {
var effect = new PhotoMatrixMotion(target_mc, "normal", "luminance", None.easeNone, 30, false);
},2000);
};