Mi sa che devi riscrivere l'intero file, perché c'è la funzione append, ma non quella per scriverci prima (se sbaglio, spero qualcuno mi cazzi e mi corregga ;-P).
Codice PHP:
//apri il file
$filename = "/usr/local/something.txt";
$handle = fopen($filename, "r");
//leggi il file
$contents = fread($handle, filesize($filename));
//chiudi il file
fclose($handle);
//aggiungi la riga
$content = "69,90,81,76,24,4,13,64,7,82,\n".$content;
//rapri il file
$filename = "/usr/local/something.txt";
//questa volta in scrittura
$handle = fopen($filename, "w");
//scrivi il contenuto
fwrite($handle, $content);
//chiudi il tutto
fclose($handle);