Puoi usare il net user per cambiare la password semplicemente specificando la password sulla linea di comando, ma ti consiglio di evitare di impelagarti con accrocchi del genere, usa direttamente le classi pensate per fare questi mestieri.
http://bytes.com/forum/thread260994.html
http://msdn.microsoft.com/en-us/library/ms817839.aspx