Ho appena dato un'occhiata all'articolo che hai indicato e credo che la cosa si possa risolvere in questo modo:
Quando richiami la funzione per l'apertura della pop-up passi una stringa vuota come parametro dell'URL:
codice:
addpop(nome,url,tools,iw,ih,fw,fh,inleft,intop,fileft,fitop,passow,passoh,ms,af,noslide);
diventa
codice:
addpop('miaPopup','','...','...','...','...',ecc...);
Poi utilizzi le funzioni indicate nell'articolo stesso per far partire l'animazione e per caricare la pagina:
standardpopup.play();
standardpopup.location(pagina.html);
Secan