Ho questo codice qui in php e nel form htm, nel form se inserisco un'email con caratteri maiuscoli esce l'alert js e va bene.
Poi disinserisco i js ma con questa stringa php se qualche carattere è maiuscolo l'alert non esce e la invia

if(!(eregi("^[!#$&'*+/-9=?a-z^-~-]+(\\.[!#$&'*+/-9=?a-z^-~-]+)*@[!#$&'*+/-9=?a-z^-~-]+(\\.[!#$&'*+/-9=?a-z^-~-]+)+$",$email)))
$errore .= "Inserire un'Email valida";
if ($errore)
echo $errore;