prendi il tuo primo if
	codice:
	if ((form1.modulo13.value != "abc7") || 
    (form1.modulo13.value != "ABC7") || 
    (form1.modulo13.value != "AbC7")){  
 
e supponi che il valore di quel campo sia "antani"
quella condizione diventa
	codice:
	if (true || true || true)
 
se vuoi entrare nell'if quando il valore non è uno di quei tre dovrai scrivere
	codice:
	if (!(
    (form1.modulo13.value == "abc7") || 
    (form1.modulo13.value == "ABC7") || 
    (form1.modulo13.value == "AbC7")
   )){  
 
inoltre se hai molte condizioni da controllare e non solo tre è meglo fare un array lookup o un object lookup (sui browser meno recenti)
del tipo
	codice:
	var condizioniTuttoSommatoAccettabili = ['abc7', 'Abc7', 'ABC7', 'Anchequestovabene'];
if (condizioniTuttoSommatoAccettabili.indexOf(form1.modulo13.value) < 0) {
   alert(...)
};
 
infine, se il tuo scopo è controllare solo un diverso confronto di maiuscole e minuscole dell'input inserito, ti conviene fare uno string.toLowerCase() (o toUpperCase()) e fare UN solo confronto sul dato in minuscolo (o maiuscolo)