Modificare un oggetto attraverso l'editing di una jTable

[MBdip]

private SquadreTableModel squadreTableModel;

intendi operare sul modello anzichè sulla tabella?
esempio

private void jButtonImpostaCapitanoActionPerformed(java.awt.event.ActionEvent evt) {

        int rowIndex=jTableSquComponenti.getSelectedRow();
        int rowSquadraIndex =jTableSqu.getSelectedRow();
/******/SquadreTableModel squadreTableModel= (SquadreTableModel)jTableSqu.getModel();/***/
        if(rowIndex<0)
            lblMessage.setText(Errori.errSelezionareRiga);
        else{
            Squadra s=database.get_ArchivioSquadre().getSquadre().get(rowSquadraIndex);
            Giocatore g=s.get_componenti().get(rowIndex);
/*********/ squadreTableModel.setCapitano(s,g);/*********************************/
        }
    }

[andbin]

intendi operare sul modello anzichè sulla tabella?

Appunto dovresti, certo, operare sul model. Dentro il model puoi modellare le cose come meglio credi (es. il fatto di aver implementato un table model che contiene un ArrayList<Squadra>) e da lì puoi "esporre" le operazioni che servono e sono utili al resto della applicazione.
Su JTable direttamente c'è relativamente ben poco che puoi fare riguardo i dati e oltretutto gli indici di riga/colonna sono nella "view" ... non direttamente sul model (possono differire).

private void jButtonImpostaCapitanoActionPerformed(java.awt.event.ActionEvent evt) {

        int rowIndex=jTableSquComponenti.getSelectedRow();
        int rowSquadraIndex =jTableSqu.getSelectedRow();
/******/SquadreTableModel squadreTableModel= (SquadreTableModel)jTableSqu.getModel();/***/
        if(rowIndex<0)
            lblMessage.setText(Errori.errSelezionareRiga);
        else{
            Squadra s=database.get_ArchivioSquadre().getSquadre().get(rowSquadraIndex);
            Giocatore g=s.get_componenti().get(rowIndex);
/*********/ squadreTableModel.setCapitano(s,g);/*********************************/
        }
    }

squadreTableModel.setSquadra(rowSquadraIndex, s);

invece di quel setCapitano

[MBdip]

ok, capito. ti ringrazio molto