Ora non ho ben presente come sono costituiti i vari file php dei temi wordpress a livello di struttura del layout ma, a prescindere da questo, prima di fornire una possibile soluzione bisogna grossomodo chiarire come sono annidati i vari elementi all'interno del layout, se è come hai applicato il position, se e come hai impostato eventuali proprietà flexbox e/o grid e/o float, se non ci sono errori nel markup per cui il layout si sfascia, ecc...

Dalle sole indicazioni e dalle immagini che hai fornito non è possibile conoscere queste cose e risalire alle cause del problema; si possono solo fare delle ipotesi in maniera generica senza magari arrivare ad una conclusione.

Sarebbe più pratico ed opportuno, per chi vuole darti aiuto, poter consultare la pagina (o le pagine) in questione. Se il sito è accessibile pubblicamente online, e se ti è possibile, posta il link.