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A me interessa che nessun virus modifichi il contenuto della chiavetta.
Il virus ha ben altri mezzi per scrivere su file e inibire eventuali limitazioni hardware.
In ogni caso, ripeto, il sistema operativo fornisce qualche policy configurabile a riguardo.
Non c'è bisogno di una applicazione, e un'applicazione (come ti è stato detto in risposte precedenti) non ha questi poteri.

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Inutile mettere un Anti-virus, poiché se esso non è aggiornato a nulla serve.
Se il problema è la protezione da virus, meglio un antivirus che - pur non aggiornato - di certo sa meglio come prevenire infezioni rispetto a un'applicazione custom che si limita a scrivere su un pen drive.

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Se invece il solo programma ha la potenzialità(forse anche accedendo con super user?) di modificare i dati all'interno dell'unità, dove esso produce file utili in questa unità, a me pare sicuro.
Io non installerei mai un'applicazione che mi impedisce di scrivere su una unità.
Detto questo, direi che le risposte sono state fornite, anche da altri utenti.