non so se sarebbe stato utile al tuo caso

ma anche salvare il file con un altro nome tipo file-copia.fla (e poi rinominarlo "a mano" file.fla) ne diminuisce la dimensione - il "salva con nome" sostituendo il vecchio file non basta -

probabilmente nei .fla c'e' una specie di cache che tiene traccia anche di dati ormai eliminati