Uno dei file che prende spazio è il pagefile.sys che, come hai detto tu, è l'area di swap della memoria...l'altro sono i punti di ripristino del sistema operativo...non lo vedi perchè, a memoria perchè l'ho disabilitato sul mio pc, dovrebbe essere una cartella nascosta...prova a disabilitare i punti di ripristino da tasto dx su risorse del computer - proprietà - ripristino configurazione di sistema.

Altra cosa potrebbe essere il file immagine che utilizza vmware...ma non conosco proprio bene questo programma e potrei dire una stupidaggine.