The Rails Way, Addison-Wesley.
A mio avviso è la più completa referenza su Rails esistente, parlando di libri.

Se avete anche link per risorse online che magari trattino nello specifico Rails con MySQL sarebbe ottimo (guide di HTML.it a parte).
Con ActiveRecord il tipo di database è pressoché poco importante.
Ad esempio, io in locale sviluppo con sqlite, in production uso MySQL e sui server aziendali PostgreSQL tutto senza cambiare una virgola.

Ovviamente la conoscenza dell'architettura di un database è importante (ad esempio sapere come PostgreSQL gestisce le transazioni risoetto a MySQL) ma qui stiamo parlando di cultura di dbadmin, non riguarda Rails.