Sono domande da fare all'ufficio brevetti più vicino.
Cmq, sì, ogni opera dell'ingegno può essere brevettata e quindi, in un certo qual modo, protetta.
I diritti li prendi quando il software lo vendi.
Se lo hai messo in rete, hai già dato, tacitamente, l'autorizzazione al libero uso (es. un gioco) ma ciò che fa TUO il sofware è il file sorgente (tientelo stretto e, in caso di proposte, vendilo a caro prezzo). Sempre che la cosa interessi a potenziali acquirenti.