Allora, forse, stiamo parlando di due cose diverse:
1. l'allineamento di uno o più mc allo stage è possibile tramite il pannello Allinea; le opzioni sono:
a. tutto a sinistra
b. tutto a destra
c. al centro, orizzontalmente
d. al centro, verticalmente
e. al centro, sia verticalmente che orizzontalmente
f. al centro perfetto
g. a sinistra, solo orizzontalmente (non modifica il valore y di partenza)
h. a destra, solo orizzontalmente (non modifica il valore y di partenza)
i. a destra, solo orizzontalmente e anche al centro
l. a sinistra, solo orizzontalmente e anche al centro.
m. (forse me ne sfugge anche qualcun'altra)

2. Probabilmente, stai parlando del cosiddetto "Punto di registrazione", vale a dire le coordinate centrali, oppure quelle che vedono: [x = 0] e [y = 0], cioè: nell'angolo in alto a sinistra.

Quando sei all'interno di un mc, noti una crocetta; quello è il punto di registrazione del mc.
Noti anche un "cerchietto" (il mirino).
Il punto di registrazione, per far sì che non cambi, qualora tu vada a spostare il mc, è bene che sia centrale cioè: il "cerchietto-mirino" deve coincidere col centro della crocetta. Questo si fa tramite il pannello "Allinea".
Puoi farlo - anche - numericamente, dando le coordinate tramite il pannello "Informazioni" (Ctrl+I)