Qualunque certificato (correttamente emesso ed installato) in un sito https:// evita al navigatore di dover "accettare" il sito, quindi non ci sono problemi (url verde o meno)

Il dominio a cui associ il certificato è sempre qualcosa del tipo "pippo.it" e nel caso tu acquistassi uno wildcard potresti certificare tutti i sul eventuali SUBdomini (aaa.pippo.it, bbb.pippo.it, etc)
Non puoi quindi usarlo per "pippo.it" e "pluto.com"

Se invece tu volessi usare lo stesso certificato per più domini, anche quindi con nomi diversi tra loro, credo (ma ti sto dicendo quanto ho capito dal sito della GoDaddy, non ho mai fatto una cosa del genere) dovresti invece acquistare qualcosa del tipo "Multiple Domains UCC". In questo caso potresti usarlo per pippo.it, pluto.com, clarabella.net, aaa.pippo.it, etc

http://www.godaddy.com/ssl/ssl-certi...s.aspx?ci=8979