La domanda nel titolo è del tipo "conviene più mysql o postgresql" ma nel thread stai chiedendo se è facile passare da un db all'altro in JSP.
La domanda presente nel titolo non è di facile risposta, in generale entrambi vanno benissimo per questo tipo di progetti, anche se personalmente mi butterei più MySQL per via del maggior supporto da parte degli hosters e per la maggiore facilità di gestione, anche se nel tuo caso specifico, lavorando con JSP dovrai far uso di hosters di fascia alta che probabilmente danno a disposizione anche postgresql
Per la domanda nel tuo thread, la sezione adatta non è questa quindi riapri lì.
Lascio aperto il thread per l'eventuale questione presente nel titolo, ovvero "mysql vs postgresql"