Grazie per le ulteriori info, il browser è FF ed è impostato per visualizzare in automatico i charset, in ogni caso avevo provato a cambiarli ma non succedeva nulla.

Ho risolto impostando tutto in iso8859-1 e latin1 e salvando le pagine con notepad++ in ANSI, credo che il problema sia sorto quando ho provato a cambiare charset senza sapere che dovevo farlo in maniera omogenea e quindi ho incasinato tutto, per fortuna ora so che occorre fare attenzione e non modificare questi parametri se non sai esattamente cosa stai facendo.

Grazie per le informazioni mi sono state molto utili