usare nella servlet qualcosa del tipo:
FileWriter fw = new FileWriter(file,true);
BufferedWriter bw = new BufferedWriter(fw);
bw.write(s.getID());
bw.newLine();

potrebbe andare anche bene?
mi auto rispondo, si! ora fa proprio quello che doveva fare!
l'unica cosa che ora non capisco è perché le modifiche si vedono nei file nella cartella: C:\ProgramFiles\eclipse2\workspace_Eclipse\.metadata\.plugins\org.eclipse.wst.server.core\tmp0\wtpwebapps\ApplicazioneCalcioItaliaServer\WEB-INF\File_del_Server\Calendario_A_1314.txt
e non in quella che mi sarei aspettatto: C:\ProgramFiles\eclipse2\workspace_Eclipse\ApplicazioneCalcioItaliaServer\WEB-INF\File_del_Server\Calendario_A_1314.txt