Tempo fa feci questo, vedi se va.... 
In una classe a parte:
codice:
Imports System.Web
Public Class JavaScript
Public Shared Sub EseguiBlockScript(ByVal Pagina As System.Web.UI.Page, ByVal NomeScript As String)
Dim js As String = NomeScript & "();"
If (Not Pagina.ClientScript.IsClientScriptBlockRegistered("clientscript_eseguijs")) Then
Pagina.ClientScript.RegisterClientScriptBlock(Pagina.GetType, "clientscript_eseguijs", js, True)
End If
End Sub
End Class
dal codice
JavaScript.EseguiBlockScript(Me,NomeDelloScript)