Ok,
Quindi ricapitolando hai un campo ID di tipo bigint, non è identity e il valore lo calcoli tu ogni volta facendo max + 1
Il tuo problema è che la tabella contiene 96 record e invece la Count ti restituisce solo 92

Sei sicuro che ci siano effettivamente 96 record nella tabella?
Come hai inserito i dati? non è che non hai chiuso la transazione di alcune insert?