Per calcolare il totale di tutte le righe lo fai con un ciclo for del contatore e non ci sono problemi.
Se ti si blocca probabilmente non hai decrementato il contatore quando elimini una riga.
Apri la console (F12) e vedi che errore c'è, perché se si blocca un errore c'è di sicuro.
Se non ci riesci postami il codice che calcola il totale e l'errore della console.