Utilizzo parseInt

[andbin]

ok, allora se decido di dichiararli come interi, come faccio a farli leggere al BufferedReader?

Con BufferedReader leggi "a righe" (String) e basta.
Con StringTokenizer spezzi la riga in token (che sono sempre String!) e basta.
E i token che ti aspetti siano interi li devi parsare TU nel modo che ritieni opportuno (es. parseInt di Integer).

Tutto qui. Non cercare problemi dove non ce ne sono.