Ho provato e funziona.
L'unico problema:
Per rendere il tutto automatico, ho scritto i comandi su un file .bat.
Nella prima istruzioni passo il parametro tramite %0 (come già testato e funzionante da prompt) soltanto che dopo aver eseguito il bat, il mio programma anziché ricevere come Input il suo stesso percorso, riceve il percorso del file Bat appena eseguito.
Sbaglio qualcosa nel creare il file Bat o nel passaggio dei parametri?