In realtà si, ma solo con browser non di casa Microsoft.
per farlo è necessario codificare il PDF su base 64, dopo puoi accodarlo all'url della finestra (o scheda o iframe o object ecc..) che apri da javascript. Il problema è che IE e derivati non supportano url più grandi di "tot" (non ricordo mi pare 1024, ma forse ci rientra qualche immagine, non un pdf medio).