Premesso che con html e css non si creano pagine dinamiche, una sottocartella è... una sottocartella, come sul PC fai "Nuova -> Cartella".
Sullo spazio web dove ora hai caricato i file, crei una cartella e la chiami come vuoi, per esempio blog, e i file di WP li metti lì dentro.
Per mettere un link nel menu al blog ti basta un
codice:
<a href="http://tuosito.com/blog">Blog</a>