per includere file diversi dal codeBehind puoi includerli in qualsiasi perte del tuo documento e all'interno di tag diversi da html.

Per esempio se hai una pagina default.aspx nella quale visualizzi sempre una intestazione un menu sinistro e un piè di pagina puoi creare una tabella nella default con 3 rige dove nella prima riga includi il file intestazione.aspx, nella terza il file intestazione.aspx e nella colonna di sinistra della seconda riga il file menu.aspx. Oppure se hai file di testo.inc o altro li includi sempre con include dove vuoi però per i codeBehind non ti garantisco che funzioni.Spero di essere stato chiaro.