L'andamento "a scatti" può dipendere da diverse cose.
1) Visione di un filmato in rete (Internet):
 una connessione lenta ed un filmato "pesante" possono creare questi problemi... soluzione: inserire un preloader

2) Se non è il primo caso, allora significa che le operazioni che esegue il filmato sono troppo onerose per il processore del PC.
Quindi potrebbero essere script esigenti o effetti speciali pesanti (per esempio l'uso pesante dell'alpha, ingrandimenti e rimpicciolimenti esagerati)

3) detto questo occorre considerare che l'occhio umano vede all'incirca 24/25 immagini al secondo, per cui se il frame rate del tuo filmato è inferiore a tale numero è possibile che l'animazione sia "scattosa"